Wade Wilson vive una vida tranquila, habiendo dejado atrás su época como el mercenario Deadpool, hasta que una organización burocrática que existe fuera del tiempo y el espacio monitorea la línea de tiempo y lo lleva a una nueva misión. Con su universo natal enfrentando una amenaza existencial, Wilson se une a regañadientes a un aún más reacio Wolverine en la misión que cambiará la historia del Universo cinematográfico de Marvel.